De Naturaliscollectie is onderverdeeld in de categorieën botanie, geologie, gewervelden, ongewervelden, entomologie, boeken en type-catalogi. Ook beschikken we over een omvangrijke bibliotheek. Een kerntaak van ons instituut is ook de digitalisering van de collectie. Door objecten te verzamelen en te bewaren, beheren we een van de grootste natuurhistorische collecties ter wereld. We brengen één wereldomvattende biodiversiteitscollectie tot stand, door voorop te lopen in samenwerkingsprojecten gericht op digitale ontsluiting. En we maken raadpleging van collectie(data) voor wetenschappelijk onderzoek, maatschappelijke doeleinden en publiekspresentaties mogelijk.