De collectie biobank bestaat uit ongeveer 150.000 DNA-extracten en 3000 weefselmonsters, die gekoeld opgeslagen worden om hun kwaliteit zo goed mogelijk te waarborgen. Daarnaast bevat de collectie ook fysieke exemplaren (de zogeheten molecular voucher specimens) waar het DNA-extract van afgenomen is.
Doelvan de Naturalis biobank
Het doel van de biobank collectie is puur wetenschappelijk. Door DNA-extracten en weefselmonsters zorgvuldig op te slaan, kunnen deze in de toekomst gebruikt worden voor nieuw onderzoek, of om huidig onderzoek te verifiëren. De Molecular voucher specimens zijn de fysieke referentie van de DNA extracten. Zij kunnen gebruikt worden om morfologische kenmerken te linken aan de genetische data. Ook kunnen deze specimens gebruikt worden om nogmaals DNA uit te isoleren.
Collectie-beheer
Zowel de DNA extracten als de weefselmonsters worden in onze -80℃ vriezers bewaard, om de kwaliteit van het DNA zo goed mogelijk te preserveren. Bij Naturalis hebben we zeven van deze vriezers tot onze beschikking, waarin we ongeveer 1.000.000 samples kunnen opslaan. Daarnaast, worden onze molecular voucher specimens bewaard in 96% ethanol op kamertemperatuur.
Grote infrastructuren
De wetenschappelijke infrastructuren van Naturalis werken nauw samen, en hebben dus ook één gezamenlijke biobank.
ARISE heeft als doel alle meercellige soorten van Nederland in kaart te brengen, onder andere op DNA-niveau. Deze DNA-extracten worden, waar mogelijk samen met het fysieke exemplaar, opgeslagen in de biobank.
Binnen het project Biodiversity Genomics Europe heeft Naturalis bijgedragen aan het in kaart brengen van de Europese biodiversiteit, onder meer door DNA barcoding van Naturalis museum-specimens. De DNA-extracten worden bewaard in onze biobank.
eDentity monitort de Nederlandse biodiversiteit met behulp van DNA uit water-, grond- en luchtmonsters. Door te kijken van welke soorten dit DNA is, kan de status van de Nederlandse biodiversiteit op een nieuwe manier in de gaten gehouden worden. Een deel van deze DNA-extracten zal opgenomen worden in de biobank als referentie. .
ARISE: Nederlandse soorten kennen en herkennen
Biodiversity Genomics Europe: BGE
eDentity: een nationale eDNA-infrastructuur
De informatieuit de biobank
Onze sequentiedata zijn publiekelijk toegankelijk via BOLD
Ook zijn we aangesloten bij het Global Genome Biodiversity Network.
