Ik ben een moleculair ecoloog en geïnteresseerd in het gebruik van DNA voor de analyse van biodiversiteit, op het niveau van het genoom tot op ecosystemen. Ik heb met analyses van het volledige genoom gewerkt om de ecologische aanpassing aan extreme omstandigheden te onderzoeken. Ik ben ook geïnteresseerd in het gebruik van eDNA en metagenomica voor het monitoren van biodiversiteit. Voor meer informatie over mijn onderzoek, bezoek mijn website op www.ilianabista.com
Keywords
Environmental Genomics, Biodiversiteit, eDNA, Biomonitoring, Comparative Genomics, Adaptatie
Onderzoekinteresses
Biodiversity Genomics
Metabarcoding en metagenomics
Comparative genomics
Transposon evolutie
Actueleonderwerpen
Applications of environmental DNA (eDNA) in biomonitoring of aquatic ecosystems.
Comparative genomics of adaptation to extreme environments - the case of the Antarctic notothenioid fish radiation.
Epigenetic regulation of transposable elements in fish genomes.
Belangrijkepublicaties
- Bista, I.*, Wood, J. M. D., Desvignes, T., McCarthy, S. A., Matschiner, M., Ning Z., Tracey A., Torrance J., Sims Y., Chow W., Smith M., Oliver K., Haggerty L., Salzburger W., Postlethwait J.H., Howe K., Clark M.S., Detrich III H.W., Cheng C.H.C., Miska E.A., Durbin R.*, (2022). Genomics of cold adaptations in the Antarctic notothenioid fish radiation. BioRxiv, 1–31. https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.06.08.494096v1.full (*Corresponding author).
- Formenti G., Theissinger K., Fernandes C., Bista I., Bombarely A., Bleidorn C., Ciofi C., Crottini A, Godoy J.A., Höglund J., Malukiewicz J., Mouton A., Oomen R. A., Paez S., Palsbøll P. J, Pampoulie C., Ruiz-López M.J, Svardal H., Theofanopoulou C., deVries J., Waldvogel A.M., Zhang G., Mazzoni C.J., Jarvis E.D., Bálint M., and The European Reference Genome Atlas (ERGA) Consortium. (2022). The era of reference genomes in conservation genomics. Trends in Ecology & Evolution, 37(3), 197–202.
- Bohmann, K., Elbrecht, V., Carøe, C., Bista, I., Leese, F., Bunce, M., Yu, D.W, Seymour, M., Dumbrell, A.J., Creer, S. (2022). Strategies for sample labelling and library preparation in DNA metabarcoding studies. Molecular Ecology Resources, 22(4), 1231–1246.
- Rhie A., McCarthy S. A., Fedrigo O., Damas J., Formenti G., Koren S., … Jarvis E. D. (2021). Towards complete and error-free genome assemblies of all vertebrate species. Nature, 592(7856), 737–746.
- Bista I.*, McCarthy S.A., Wood J... Durbin R. (2020) The genome sequence of the channel bull blenny, Cottoperca gobio (Günther, 1861). Wellcome Open Res., 5:148 (*Corresponding author).
- Bista I.*, Carvalho G. R., Tang M., … Creer S. (2018). Performance of amplicon and shotgun sequencing for accurate biomass estimation in invertebrate community samples. Mol. Ecol. Res., 1–15 (*Corresponding author).
- Deiner K., Bik H. M., Mächler E., Seymour M., Lacoursière-Roussel A., Altermatt F., Creer S., Bista I., Lodge D.M., de Vere N.… Bernatchez L. (2017). Environmental DNA metabarcoding: Transforming how we survey animal and plant communities. Mol. Ecol., 26 (21), 5872–5895.
- Bista I. *, Carvalho G.R., Walsh K., Seymour M., Hajibabaei M., Lallias D., Christmas M., Creer S. (2017). Annual time-series analysis of aqueous eDNA reveals ecologically relevant dynamics of lake ecosystem biodiversity. Nature Communications, 8, 14087 (*Corresponding author).
In demedia
DNA-based biodiversity assessment methods.
https://blog.pensoft.net/2022/01/11/extensive-practical-guide-to-dna-based-biodiversity-assessment-methods-published-as-a-living-document-by-dnaqua-net-cost-action/
