Barbara Gravendeel

Barbara Gravendeel

Ik ben botanicus en gefascineerd door het opkomende onderzoeksgebied van evolutie en ontwikkeling in een ecologische context (eco-evo-devo). Ik onderzoek hoe moleculaire mechanismen de morfologische diversiteit van plantenorganen bepalen en focus hierbij zowel op evolutionaire ontwikkeling in oude biomen (vegetatiezones) als in moderne omgevingen, met name in steden. Samen met mijn medewerkers doe ik onderzoek naar de eco-evo-devo van orchideebloemen, -fruit en -steeltjes, lampionplanten en paardenbloemen.

 

Keywords

Ontwikkeling, bloemen, fruit, genomics, herbaria, orchideeën, planten, transcriptomics, stedelijke evolutie

Prof. Dr. Barbara Gravendeel

Researcher and joint group leader
Evolutionary Ecology

barbara.gravendeel@naturalis.nl
+31 (0)6  106 64 277

Facebook

Research
interest

Evolutie en ecologie zijn nauw met elkaar verbonden. Onderzoek in de afgelopen decennia heeft aangetoond dat evolutionaire veranderingen veel sneller plaatsvinden dan eerder werd gedacht. Deze veranderingen dragen bij aan het ecologisch aanpassingsvermogen van soorten. Dergelijke aanpassingsmechanismen zijn van vitaal belang voor soorten om te overleven in het huidige tijdperk, het antropoceen.

Door de mens veroorzaakte veranderingen zijn wereldwijd een belangrijke oorzaak van de evolutie van planten. Tegenwoordig wonen steeds meer mensen in steden, wat heeft geleid tot enorme veranderingen in de omgeving en de ruimtelijke ordening van natuurlijke leefgebieden in het landschap. Wilde soorten passen zich snel aan aan een nieuwe stedelijke leefomgeving. Wij onderzoeken deze aanpassingen van stedelijke plantensoorten. Dit doen door museumcollecties te bestuderen die verzameld zijn in gebieden die de afgelopen 200 jaar steeds meer verstedelijkt zijn geraakt. We bezoeken deze gebieden opnieuw, om daar vervolgens nieuwe monsters te verzamelen. Deze monsters bestuderen we door middel van micro-morfologische en genetische hulpmiddelen. Zo kunnen we de verschillen in eigenschappen tussen planten in stedelijke en niet-stedelijke omgevingen vaststellen.

Erycina pusilla
Cynorkis fastigiata and Epipactis helleborine

Current
topics

Lees hier meer over mijn onderzoek (in het Engels).

En Tibi herbarium of tomato

Ancient tomato genomics

Past processes that shaped the current genetic diversity of the domesticated tomato are still largely unknown. Using Illumina HiSeq, we sequenced and compared full genomes from tomato accessions stored worldwide in genebanks and herbaria up to 182 years…
Lees meer
Vanilla pods analyzed in RAAK MKB project

Microbiome of Vanilla

DNA extracts of fermented fruits of species of Vanilla are currently being sequenced to obtain an impression of their microbiome, i.e. the diversity of fungi and bacteria living inside. The diversity of the microbiome is very different among vanille fruits…
Lees meer

Key
publications

  • Dirks-Mulder A., Ahmed I., uit het Broek M., Krol L., Menger N., Snier J., Winzum A. van, de Wolf A., van ‘t Wout M., Zeegers J.J., Butot R., Heijungs R., van Heuven B.J. van, Kruizinga J., Langelaan R., Smets E.F., Star W., Bemer M. Gravendeel B. 2019. Morphological and molecular characterization of orchid fruit development. Frontiers in Plant Science 10: 137. 
  • Bogarin D., Perez-Escobar O.A., Groenenberg D.S.J., Karremans A.P., Lemmon A.R., Moriarty-Lemmon E.M., Pupulin F., Smets E.F., Gravendeel B. 2018. Anchored hybrid enrichment generated nuclear, plastid and mitochondrial markers resolve the Lepathes horrida (Orchidaceae: Pleurothallidinae) species complex. Molecular Phylogenetics and Evolution 129: 27-47.
  • Dirks-Mulder, A., Butot, R., van Schaik, P., Wijnands, J.W.P.M., van den Berg, R., Krol, L., Doebar, S., van Kooperen, K., de Boer, H., Kramer, E.M., Smets, E.F., Vos, R.A., Vrijdaghs, A., Gravendeel, B. Exploring the evolutionary origin of floral organs of Erycina pusilla, an emerging orchid model system. 2017. BMC Evolutionary Biology 17: 89.
  • Merckx V.S.F.T., Hendriks K.P., Beentjes K.K., Mennes C.B., Becking L.E., Peijnenburg K.T.C.A., Afendy A., Arumugam N., de Boer H., Biun A., Buang M.M., Chen P.-P., Chung A.Y.C., Dow R., Feijen F.A.A., Feijen H., Feijen-van Soest C, Geml J., Geurts R., Gravendeel B., Hovenkamp P., Imbun P., Ipor I., Janssens S.B., Jocqué M. Kappes H., Khoo E., Koomen P., Lens F., Majapun R.J., Morgado L.N., Neupane S., Nieser N., Pereira J.T., Rahman H., Sabran S., Sawang A., Schwallier R.M., Shim P.-S., Smit H., Sol N., Spait M., Stech M., Stokvis F., Sugau J.B., Suleiman M., Sumail S., Thomas D.C., van Tol J., Tuh F.Y.Y., Yahya B.E., Nais J., Repin R., Lakim M. & Schilthuizen M. 2015. Evolution of endemism on a young tropical mountain. Nature 524: 347-350.
  • Ramirez, S.R., B. Gravendeel, R.B. Singer, C.R. Marshall & N.E. Pierce. 2007. Dating the origin of the Orchidaceae from a fossil orchid with its pollinator. Nature 448: 1042-1045.

PhD
supervision

Naturalis wil een vruchtbare bodem vormen voor wetenschappelijk talent uit binnen- en buitenland. Daarom hebben PhD-kandidaten een speciale positie binnen onze organisatie.

Postdoc:

  • Diego Bogarin
  • Annemarie Heiduk
  • Adam Karremans
  • Sarina Veldman

PhD:

  • Anita Dirks Mulder
  • Richa Kusuma Wati
  • Susanne Masters
  • Mehrdad Jahanbanifard
  • Marcel Polling
  • Dewi Pramanik
Cynorkis fastigiata and Epipactis helleborine

Teaching
activities

Ik doceer de volgende onderwerpen aan de Universiteit Leiden en Hogeschool Leiden:

  • Evolution and Development of Plants
  • Genomic Architecture
  • Urban Studies

In the
media

Oncidiinae

Publicaties